Desde 1983, cuando se realizara el primer trasplante pulmonar con excelente sobrevida a largo plazo, el trasplante se ha consolidado como una opción terapéutica  para muchos pacientes con una amplia gama de enfermedades respiratorias crónicas avanzadas.

Es trasplante pulmonar está indicado en pacientes que no responden al tratamiento médico máximo o para quienes no existe otra opción terapéutica, y con una expectativa de vida estimada inferior a 2 años.

Las indicaciones más frecuentes del trasplante pulmonar son:

• Enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC)
• Déficit de alfa 1 antitripsina
• Fibrosis pulmonar idiopática
• Fibrosis quística
• Hipertensión pulmonar primaria
• Hipertensión pulmonar secundaria defectos cardiacos
• Síndrome de Eisenmenger.

Con menor frecuencia se han trasplantado pacientes con:

• Bronquiectasias
• Sarcoidosis
• Esclerodermia
• Linfangioleiomiomatosis
• Granuloma eosinófilo pulmonar
• Histiocitosis X
• Asbestosis

Existen sin embargo, algunos parámetros que hay que poner en consideración a la hora de evaluar la conveniencia de un trasplante:

• Insuficiencia respiratoria crónica con enfermedad multisistémica (sarcoidosis,  enfermedades del colágeno)
• Posibilidad de que la enfermedad recidive en el órgano trasplantado (linfangioleiomiomatosis, sarcoidosis)
• Alternativas terapéuticas (tromboendarterectomía en la hipertensión pulmonar secundaria a embolismo pulmonar crónico)

La enfermedad de base no es el único requisito para la indicación de un trasplante, también es importante la condición del receptor (Ver: Elección del candidato)